Mona написав:
Или можно взять обычный договор подряда и дописать там % генподряда?
Можно, например: "Субподрядчик оплачивает Генподрядчику услуги генподряда в размере n% от суммы выполненных работ на основании подписаного Сторонами акта и предоставленного Генподрядчиком счета на оплату и налоговой накладной". Если не желаете ждать оплаты от субподрядчика, тогда в порядке расчетов предусмотрите пункт: "В случае возникновения между Сторонами иных сделок допускается зачет встречных однородных требований" и тогда подпишете еще акт зачета встречных требований.
Mona написав:
И еще, если мы работаем с бюджетной организацией (Заказчик) тоже можно брать % как договоримся, или в этом случае есть ограничения, может где-то можно прочитать об этом?
Никаких ограничений. Единственное условие это, чтобы в договоре между Заказчиком и Генподрядчиком было разрешено привлечение к выполнению работ субподрядных организаций.